| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Higuchi, Rina| Fujita, Yuri| Namba, Shotaro| Moriya, Hisao| |
| キーワード | yeast overexpression promoter |
| 発行日 | 2024-10-18 |
| 出版物タイトル | FEMS Yeast Research |
| 巻 | 24巻 |
| 出版者 | Oxford University Press (OUP) |
| 開始ページ | foae032 |
| ISSN | 1567-1364 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © The Author(s) 2024. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 39424601 |
| DOI | 10.1093/femsyr/foae032 |
| Web of Science KeyUT | 001345875500001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1093/femsyr/foae032 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Namba, Shotaro| Moriya, Hisao| |
| キーワード | Aggregation Fluorescent protein Hsp70 Overproduction Toxicity Yeast |
| 発行日 | 2024-06-12 |
| 出版物タイトル | Journal of Cell Science |
| 巻 | 137巻 |
| 号 | 11号 |
| 出版者 | The Company of Biologists Ltd |
| 開始ページ | jcs261977 |
| ISSN | 0021-9533 |
| NCID | AA00694823 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2024. Published by The Company of Biologists Ltd |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 38766715 |
| DOI | 10.1242/jcs.261977 |
| Web of Science KeyUT | 001267257500006 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1242/jcs.261977 |
| タイトル（別表記） | Evaluator of adaptability of S. cerevisiae to grape juice using the oversxpression profiling ADOPT method |
|---|---|
| フルテキストURL | srfa_113_001_006.pdf |
| 著者 | 守屋 央朗| 小野 千由貴| |
| 抄録 | The authors have recently developed the overexpression profiling ADOPT method. In the ADOPT method, yeast strains overexpressing most of the genes in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae genome are mixed and competitively cultured, and the genes overexpressed in the enriched strains are systematically identified. Furthermore, the identified genes can be used to identify bottleneck factors that are necessary but lacking for growth of S. cerevisiae under given conditions. In our previous studies, we have identified bottlenecks in artificially created stress environments in the laboratory, but in this study, we used grape juice for winemaking as an example to see if industrial bottlenecks can be identified. ADOPT experiments with sulfite-added grape juice used in conventional winemaking resulted in a strong enrichment of strains overexpressing the sulfite pump SSU1 and its transcription factor FZF1. Since enhancement of SSU1 function is known to occur in wine yeast acclimation, ADOPT was also shown to be useful in the search for industrial bottlenecks. On the other hand, no genes were strongly enriched by ADOPT in grape juice without sulfite addition, suggesting that grape juice is a balanced medium with few bottlenecks for S. cerevisiae growth. |
| キーワード | yeast S. cerevisiae overexpression wine making |
| 出版物タイトル | 岡山大学農学部学術報告 |
| 発行日 | 2024-02-01 |
| 巻 | 113巻 |
| 開始ページ | 1 |
| 終了ページ | 6 |
| ISSN | 2186-7755 |
| 言語 | 日本語 |
| 論文のバージョン | publisher |
| フルテキストURL | fulltext20230828-02.pdf |
|---|---|
| 著者 | Ono, Ryota| Saeki, Nozomu| Kojima, Keiichi| Moriya, Hisao| Sudo, Yuki| |
| キーワード | UVA Saccharomyces cerevisiae Iodide Growth inhibition Suppressive molecule |
| 備考 | © 2023 Elsevier Inc. This manuscript version is made available under the CC-BY-NC-ND 4.0 license https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/| This fulltext file will be available in Oct. 2024.| |
| 発行日 | 2023-10-15 |
| 出版物タイトル | Biochemical and Biophysical Research Communications |
| 巻 | 677巻 |
| 出版者 | Elsevier BV |
| 開始ページ | 1 |
| 終了ページ | 5 |
| ISSN | 0006-291X |
| NCID | AA00564395 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2023 Elsevier Inc. |
| 論文のバージョン | author |
| PubMed ID | 37523893 |
| DOI | 10.1016/j.bbrc.2023.07.048 |
| Web of Science KeyUT | 001047346900001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2023.07.048 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Saeki, Nozomu| Yamamoto, Chie| Eguchi, Yuichi| Sekito, Takayuki| Shigenobu, Shuji| Yoshimura, Mami| Yashiroda, Yoko| Boone, Charles| Moriya, Hisao| |
| 発行日 | 2023-04-28 |
| 出版物タイトル | PLoS Genetics |
| 巻 | 19巻 |
| 号 | 4号 |
| 出版者 | Public Library of Science |
| 開始ページ | e1010732 |
| ISSN | 1553-7404 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2023 Saeki et al. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 37115757 |
| DOI | 10.1371/journal.pgen.1010732 |
| Web of Science KeyUT | 000978623500001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1010732 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Namba, Shotaro| Kato, Hisaaki| Shigenobu, Shuji| Makino, Takashi| Moriya, Hisao| |
| キーワード | yeast fluorescent protein cytotoxicity protein burden heat shock response morphology proteasome |
| 発行日 | 2022-04-29 |
| 出版物タイトル | g3－Genes Genomes Genetics |
| 巻 | 12巻 |
| 号 | 6号 |
| 出版者 | Oxford Univ Press Inc. |
| 開始ページ | jkac106 |
| ISSN | 2160-1836 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © The Author(s) 2022. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 35485947 |
| DOI | 10.1093/g3journal/jkac106 |
| Web of Science KeyUT | 000796686500001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1093/g3journal/jkac106 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Kintaka, Reiko| Makanae, Koji| Namba, Shotaro| Kato, Hisaaki| Kito, Keiji| Ohnuki, Shinsuke| Ohya, Yoshikazu| Andrews, Brenda J.| Boone, Charles| Moriya, Hisao| |
| 発行日 | 2020-11-04 |
| 出版物タイトル | eLife |
| 巻 | 9巻 |
| 出版者 | eLife Sciences Publications |
| 開始ページ | e54080 |
| ISSN | 2050-084X |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © Kintaka et al. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 33146608 |
| DOI | 10.7554/eLife.54080 |
| Web of Science KeyUT | 000592848100001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.7554/eLife.54080 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Ishikawa, Koji| Ishihara, Akari| Moriya, Hisao| |
| 発行日 | 2020-10-28 |
| 出版物タイトル | PLoS Genetics |
| 巻 | 16巻 |
| 号 | 10号 |
| 出版者 | Public Library of Science |
| 開始ページ | e1009091 |
| ISSN | 1553-7404 |
| NCID | AA12073492 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2020 Ishikawa et al. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 33112847 |
| DOI | 10.1371/journal.pgen.1009091 |
| Web of Science KeyUT | 000588362000001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1009091 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Mori, Yoshihiro| Yoshida, Yuki| Satoh, Ayano| Moriya, Hisao| |
| キーワード | Biological techniques Cell biology Gene expression analysis Molecular biology Protein translocation Protein transport |
| 発行日 | 2020-03-16 |
| 出版物タイトル | Scientific Reports |
| 巻 | 10巻 |
| 号 | 1号 |
| 出版者 | Nature |
| 開始ページ | 4798 |
| ISSN | 2045-2322 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © The Author(s) 2020 |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 32179769 |
| DOI | 10.1038/s41598-020-61646-3 |
| Web of Science KeyUT | 000562125100001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-020-61646-3 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Saeki, Nozomu| Eguchi, Yuichi| Kintaka, Reiko| Makanae, Koji| Shichino, Yuichi| Iwasaki, Shintaro| Kanno, Manabu| Kimura, Nobutada| Moriya, Hisao| |
| キーワード | Cell growth Gene expression Gene regulation |
| 発行日 | 2020-06-11 |
| 出版物タイトル | Scientific Reports |
| 巻 | 10巻 |
| 号 | 1号 |
| 出版者 | Nature |
| 開始ページ | 9500 |
| ISSN | 2045-2322 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © The Author(s) 2020 |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 32528012 |
| DOI | 10.1038/s41598-020-66307-z |
| Web of Science KeyUT | 000559960100018 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-020-66307-z |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Nemoto, Michiko| Iwaki, Sayako| Moriya, Hisao| Monden, Yuki| Tamura, Takashi| Inagaki, Kenji| Mayama, Shigeki| Obuse, Kiori| |
| キーワード | Biomineralization Diatom Silica Transcriptome Proteome |
| 備考 | This is a post-peer-review, pre-copyedit version of an article published in Marine Biotechnology. The final authenticated version is available online at: http://dx.doi.org/10.1007/s10126-020-09976-1.| |
| 発行日 | 2020-06-03 |
| 出版物タイトル | Marine Biotechnology |
| 出版者 | Springer |
| ISSN | 1436-2228 |
| NCID | AA11357643 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | フランス語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 論文のバージョン | author |
| PubMed ID | 32488507 |
| DOI | 10.1007/s10126-020-09976-1 |
| Web of Science KeyUT | 000537432000001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1007/s10126-020-09976-1 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Moriya, Hisao| |
| キーワード | green fluorescent protein overexpression expression limit expression level protein cytotoxicity |
| 発行日 | 2020-05-14 |
| 出版物タイトル | AIMS Biophysics |
| 巻 | 7巻 |
| 号 | 2号 |
| 出版者 | AIMS Press |
| 開始ページ | 121 |
| 終了ページ | 132 |
| ISSN | 2377-9098 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2020 the Author(s), licensee AIMS Press. |
| 論文のバージョン | publisher |
| DOI | 10.3934/biophy.2020010 |
| Web of Science KeyUT | 000535774000005 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.3934/biophy.2020010 |
| タイトル（別表記） | Mathematical analysis of copy number variation of 2 μ-based plasmids in yeast cells |
|---|---|
| フルテキストURL | srfa_109_007_011.pdf |
| 著者 | 佐伯 望| 守屋 央朗| |
| 抄録 | Plasmids with the 2 μ plasmid origin are commonly-used in the genetic engineering of the budding yeast Saccharomyces cerevisiae. Intracellular copy numbers of 2 μ plasmids are different depending on the genes inserted into the plasmids. This difference is thought to occur from the difference in the growth efficiency （fitness） produced by the positive- and negative-selection biases of genes inserted in the plasmid. In this study, we made a mathematical model based on this assumption. Computational simulations of the model validated that copy numbers of the plasmids are rapidly settled depending on the fitness created by the gene on the plasmid. The copy number of a plasmid only contains a bias to keep the plasmid in a single copy became average 20copies per cell when the plasmid is randomly distributed, suggesting that no positive distribution mechanism is required for a plasmid to become multicopy. |
| キーワード | yeast 2 μ plasmid mathematical model |
| 出版物タイトル | 岡山大学農学部学術報告 |
| 発行日 | 2020-02-01 |
| 巻 | 109巻 |
| 開始ページ | 7 |
| 終了ページ | 11 |
| ISSN | 2186-7755 |
| 言語 | 日本語 |
| 論文のバージョン | publisher |
| フルテキストURL | SR9_1_8866.pdf |
|---|---|
| 著者 | Abe-Kanoh, Naomi| Kunisue, Narumi| Myojin, Takumi| Chino, Ayako| Munemasa, Shintaro| Murata, Yoshiyuki| Satoh, Ayano| Moriya, Hisao| Nakamura, Yoshimasa| |
| 発行日 | 2019-6-20 |
| 出版物タイトル | Scientific Reports |
| 巻 | 9巻 |
| 出版者 | Nature Publishing Group |
| 開始ページ | 8866 |
| ISSN | 2045-2322 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © The Author(s) 2019 |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 31222108 |
| DOI | 10.1038/s41598-019-45248-2 |
| Web of Science KeyUT | 000472136900040 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-019-45248-2 |