検索結果 - 岡山大学学術成果リポジトリ

A solvation-free-energy functional: A reference-modified density functional formulation

フルテキストURL	J_Comput_Chem_36_18_135.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Mitsutake, Ayori\| Maruyama, Yutaka\|
キーワード	salvation-free-energy classical density functional theory 3D-RISM theory water amino acid side-chain chignolin
発行日	2015-05-31
出版物タイトル	Journal of Computational Chemistry
巻	36巻
号	18号
開始ページ	1359
終了ページ	1369
ISSN	01928651
NCID	AA00257341
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	26032201
DOI	10.1002/jcc.23942
Web of Science KeyUT	000356310800002
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1002/jcc.23942

A reference-modified density functional theory: An application to solvation free-energy calculations for a Lennard-Jones solution

フルテキストURL	J_ChemPhys_144_22_224104.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Maruyama, Yutaka\| Mitsutake, Ayori\| Koga, Kenichiro\|
発行日	2016-06-10
出版物タイトル	Journal of Chemical Physics
巻	144巻
号	22号
出版者	American Institute of Physics
開始ページ	224104
ISSN	00219606
NCID	AA00694991
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	27305993
DOI	10.1063/1.4953191
Web of Science KeyUT	000378926100007
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1063/1.4953191

Model-potential-free analysis of small angle scattering of proteins in solution: insights into solvent effects on protein-protein interaction

フルテキストURL	PhysChemChemPhys_16_46_25492.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Imamura, Hiroshi\| Morita, Takeshi\| Isogai, Yasuhiro\| Nishikawa, Keiko\|
発行日	2014-10-17
出版物タイトル	Physical Chemistry Chemical Physics
巻	16巻
号	46号
出版者	Royal Society of Chemistry
開始ページ	25492
終了ページ	25497
ISSN	14639076
NCID	AA11301773
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	25343423
DOI	10.1039/c4cp03606a
Web of Science KeyUT	000344989500036
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1039/c4cp03606a

A model-free method for extracting interaction potential between protein molecules using small-angle X-ray

フルテキストURL	J_MoleculLiq_200_42.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Imamura, Hiroshi\| Morita, Takeshi\| Nishikawa, Keiko\|
キーワード	Protein solutions Lysozyme Protein-protein interaction Liquid state theory Integral equation DLVO model
発行日	2014-04-01
出版物タイトル	Journal of Molecular Liquids
巻	200巻
号	Part.A号
出版者	Elsevier Science
開始ページ	42
終了ページ	46
ISSN	01677322
NCID	AA10636062
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
DOI	10.1016/j.molliq.2014.03.014
Web of Science KeyUT	000347592900010
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.molliq.2014.03.014

Numerical calculation on a two-step subdiffusion behavior of lateral protein movement in plasma membranes

フルテキストURL	PhysRevE_96_4_042410_a.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Okumoto, Atsushi\| Goto, Hitoshi\| Sekino, Hideo\|
発行日	2017-10-19
出版物タイトル	Physical review. E.
巻	96巻
号	4-1号
出版者	American Physical Society
開始ページ	042410
ISSN	24700045
NCID	AA11558033
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	29347488
DOI	10.1103/PhysRevE.96.042410
Web of Science KeyUT	000413293200004
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1103/PhysRevE.96.042410

Is F-1-ATPase a Rotary Motor with Nearly 100% Efficiency? Quantitative Analysis of Chemomechanical Coupling and Mechanical Slip

フルテキストURL	Nanolett_19_5_3370.pdf SI_Nanolett_19_5_3370.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Klumpp, Stefan\|
キーワード	F-1-ATPase rotary molecular motor chemomechanical network model free-energy transduction efficiency ATP synthesis torque-induced mechanical slip
発行日	2019-04-24
出版物タイトル	Nano Letters
巻	19巻
号	5号
出版者	American Chemical Society
開始ページ	3370
終了ページ	3378
ISSN	15306984
NCID	AA11511812
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	Copyright © 2019 American Chemical Society
論文のバージョン	author
PubMed ID	31017791
DOI	10.1021/acs.nanolett.9b01181
Web of Science KeyUT	000467781900078
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.9b01181

Erratum: "A solvation-free-energy functional: A reference-modified density functional formulation" [J. Comput. Chem. 2015, 36, 1359-1369].

フルテキストURL	J_ComputChem_36_26_2015.pdf SI_J_Comput_Chem_36_18_135.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Mitsutake, Ayori\| Maruyama, Yutaka\|
発行日	2015-07-31
出版物タイトル	Journal of computational chemistry
巻	36巻
号	26号
出版者	Wiley
開始ページ	2009
終了ページ	2011
ISSN	01928651
NCID	AA00257341
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	26339760
DOI	10.1002/jcc.24035
Web of Science KeyUT	000360807700008
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1002/jcc.24035

Effects of hydrophobic hydration on polymer chains immersed in supercooled water

フルテキストURL	RSC_Advances_2013_3_12743.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Sekino, Hideo\|
発行日	2013-05-07
出版物タイトル	RSC Advances
巻	3巻
号	31号
出版者	Royal Society of Chemistry
開始ページ	12743
終了ページ	12750
ISSN	20462069
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	publisher
DOI	10.1039/C3RA41320A
Web of Science KeyUT	000321791200034
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1039/C3RA41320A

Development of Genome-Wide SNP Markers for Barley via Reference- Based RNA-Seq Analysis

フルテキストURL	FrontPlantSci_10_577.pdf
著者	Tanaka, Tsuyoshi\| Ishikawa, Goro\| Ogiso-Tanaka, Eri\| Yanagisawa, Takashi\| Sato, Kazuhiro\|
キーワード	Japanese barley breeding RNA-Seq amplicon sequencing barley; genotyping barley genotyping
発行日	2019-05-10
出版物タイトル	Frontiers in plant science.
巻	577巻
出版者	Frontiers Research Foundation
開始ページ	577
ISSN	1664-462X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	Copyright © 2019 Tanaka, Ishikawa, Ogiso-Tanaka, Yanagisawa and Sato.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	31134117
DOI	10.3389/fpls.2019.00577
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.3389/fpls.2019.00577

Genome-Edited Triple-Recessive Mutation AltersSeed Dormancy in Wheat

フルテキストURL	CellRep_28_5_1362.pdf
著者	Abe, Fumitaka\| Haque, Emdadul\| Hisano, Hiroshi\| Tanaka, Tsuyoshi\| Kamiya, Yoko\| Mikami, Masafumi\| Kawaura, Kanako\| Endo, Masaki\| Onishi, Kazumitsu\| Hayashi, Takeshi\| Sato, Kazuhiro\|
キーワード	CRISPR/Cas9 Qsd1 multiple mutation seed dormancy wheat
発行日	2019-07-30
出版物タイトル	Cell Reports
巻	28巻
号	5号
出版者	Cell Press
開始ページ	1362
終了ページ	1369
ISSN	22111247
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	31365876
DOI	10.1016/j.celrep.2019.06.090
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.06.090

Upregulation of mobility in pancreatic cancer cells by secreted S100A11 through activation of surrounding fibroblasts

フルテキストURL	K0006040_abstract_review.pdf K0006040_fulltext.pdf K0006040_Other2(Suppl Figure).pdf
著者	光井洋介\|
発行日	2019-09-25
資料タイプ	学位論文
学位授与番号	甲第6040号
学位授与年月日	2019-09-25
学位・専攻分野	博士（医学）
授与大学	岡山大学
言語	英語

Histidine-rich glycoprotein augments natural killer cell function by modulating PD-1 expression via CLEC-1B

フルテキストURL	K0006034_abstract_review.pdf K0006034_fulltext.pdf
著者	西村義人\|
発行日	2019-09-25
資料タイプ	学位論文
学位授与番号	甲第6034号
学位授与年月日	2019-09-25
学位・専攻分野	博士（医学）
授与大学	岡山大学
言語	英語

Effect of the interaction of metformin and bone morphogenetic proteins on ovarian steroidogenesis by human granulosa cells

フルテキストURL	K0006031_abstract_review.pdf K0006031_fulltext.pdf
著者	岩田菜穂子\|
発行日	2019-09-25
資料タイプ	学位論文
学位授与番号	甲第6031号
学位授与年月日	2019-09-25
学位・専攻分野	博士（医学）
授与大学	岡山大学
言語	英語

The epithelial-to-mesenchymal transition induced by tumor-associated macrophages confers chemoresistance in peritoneally disseminated pancreatic cancer

フルテキストURL	K0006029_abstract_review.pdf K0006029_fulltext.pdf
著者	桒田和也\|
発行日	2019-09-25
資料タイプ	学位論文
学位授与番号	甲第6029号
学位授与年月日	2019-09-25
学位・専攻分野	博士（医学）
授与大学	岡山大学
言語	英語

The Golgin Protein Giantin Regulates Interconnections Between Golgi Stacks

フルテキストURL	fcell_2019_00160_p.pdf fcell_2019_00160_a.pdf
著者	Satoh, Ayano\| Hayashi-Nishino, Mitsuko\| Shakuno, Takuto\| Masuda, Junko\| Koreishi, Mayuko\| Murakami, Runa\| Nakamura, Yoshimasa\| Nakamura, Toshiyuki\| Abe-Kanoh, Naomi\| Honjo, Yasuko\| Malsam, Joerg\| Yu, Sidney\| ishino, Kunihiko \|
キーワード	Golgi golgins glycosylation endoplasmic reticulum electron tomography
発行日	2019-08-27
出版物タイトル	Frontiers in Cell and Developmental Biology
巻	7巻
開始ページ	160
ISSN	2296634X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	31544102
DOI	10.3389/fcell.2019.00160
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.3389/fcell.2019.00160

Photochemical Characterization of a New Heliorhodopsin from the Gram-Negative Eubacterium Bellilinea caldifistulae (BcHeR) and Comparison with Heliorhodopsin-48C12

フルテキストURL	Biochemistry_58_26_2934.pdf
著者	Shibukawa, Atsushi\| Kojima, Keiichi\| Nakajima, Yu\| Nishimura, Yosuke\| Yoshizawa, Susumu\| Sudo, Yuki\|
備考	This fulltext will be available in Jun 2020\|
発行日	2019-05-31
出版物タイトル	Biochemistry
巻	58巻
号	26号
出版者	American Chemical Society
開始ページ	2934
終了ページ	2943
ISSN	00062960
NCID	AA00564599
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	31150215
DOI	10.1021/acs.biochem.9b00257
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acs.biochem.9b00257

Characterization of Pieces of Paper That Form Reagent Containers for Use as Portable Analytical Devices

フルテキストURL	ACS_Omega_4_12_15249_p.pdf
著者	Buking, Supatana\| Suedomi, Yusuke\| Nacapricha, Duangjai\| Kaneta, Takashi\|
発行日	2019-07-03
出版物タイトル	ACS Omega
巻	4巻
号	12号
出版者	American Chemical Society
開始ページ	15249
終了ページ	15254
ISSN	24701343
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	31552371
DOI	10.1021/acsomega.9b02226
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acsomega.9b02226

Characterization of burdock mottle virus, a novel member of the genus Benyvirus, and the identification of benyvirus-related sequences in the plant and insect genomes.

フルテキストURL	VirusRes_177_1_75.pdf Table 1-revised.pdf FigS-revised.pdf Figs_revised.pdf Table S.pdf
著者	Kondo, Hideki\| Hirano, Shuichi\| Chiba, Sotaro\| Andika, Ida Bagus\| Hirai, Makoto\| Maeda, Takanori\| Tamada, Tetsuo\|
キーワード	AlkB Benyvirus Burdock mottle virus Endogenous viral element Paleovirology Transcriptome shotgun assembly
発行日	2013-10
出版物タイトル	Virus Research
巻	177巻
号	1号
出版者	Elsevier Science
開始ページ	75
終了ページ	86
ISSN	01681702
NCID	AA10642076
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	23911632
DOI	10.1016/j.virusres.2013.07.015
Web of Science KeyUT	000324974100009
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.virusres.2013.07.015

Sequence and phylogenetic analyses of novel totivirus-like double-stranded RNAs from field-collected powdery mildew fungi

フルテキストURL	VirusRes_213_353.pdf tables_revised.pdf Fig S.pdf Supplementary_tables_revised.pdf
著者	Kondo, Hideki\| Hisano, Sakae\| Chiba, Sotaro\| Maruyama, Kazuyuki\| Andika, Ida Bagus\| Toyoda, Kazuhiro\| Fujimori, Fumihiro\| Suzuki, Nobuhiro\|
キーワード	Deep sequencing Double stranded RNA virus Powdery mildew Saccharomyces cerevisiae virus L-A Totivirus Ustilago maydis virus H1
発行日	2016-02
出版物タイトル	Virus Research
巻	213巻
出版者	Elsevier Science
開始ページ	353
終了ページ	364
ISSN	01681702
NCID	AA10642076
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	26592174
DOI	10.1016/j.virusres.2015.11.015
Web of Science KeyUT	000371840600042
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.virusres.2015.11.015

Phase II Trial Using Romidepsin after Gemcitabine, Dexamethasone, and Cisplatin Therapy in Elderly Transplant-Ineligible Patients with Relapsed/Refractory Peripheral T-Cell Lymphoma: Study Protocol

JaLCDOI	10.18926/AMO/57379
フルテキストURL	73_5_469.pdf
著者	Yamasaki, Satoshi\| Kada, Akiko\| Nagai, Hirokazu\| Yoshida, Isao\| Choi, Ilseung\| Saito, Akiko M.\| Iwasakia, Hiromi\|
抄録	Romidepsin is an important therapeutic option for patients with peripheral T-cell lymphoma (PTCL). However, the timing of romidepsin administration remains controversial. Romidepsin was launched in Japan as a consolidation therapy agent after conventional salvage chemotherapy with gemcitabine, dexamethasone, and cisplatin (GDP). GDP therapy will be administered every 3 weeks. If complete response, partial response, or stable disease is confirmed after 2-4 GDP cycles, romidepsin will be administered every 4 weeks. The primary endpoint is a 2-year progression-free survival rate. Patients participating in this study and undergoing treatment can expect results similar to or better than those of conventional therapies.
キーワード	peripheral T-cell lymphoma not otherwise specified angioimmunoblastic T-cell lymphoma gemcitabine cisplatin, romidepsin
Amo Type	Clinical Study Protocol
出版物タイトル	Acta Medica Okayama
発行日	2019-10
巻	73巻
号	5号
出版者	Okayama University Medical School
開始ページ	469
終了ページ	474
ISSN	0386-300X
NCID	AA00508441
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
著作権者	CopyrightⒸ 2019 by Okayama University Medical School
論文のバージョン	publisher
査読	有り
PubMed ID	31649375
Web of Science KeyUT	000491886600014