沈建仁

Structural basis for molecular assembly of fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins in a diatom photosystem I supercomplex

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kato, Koji\| Nakajima, Yoshiki\| Xing, Jian\| Kumazawa, Minoru\| Ogawa, Haruya\| Shen, Jian-Ren\| Ifuku, Kentaro\| Nagao, Ryo\|
発行日	2024-10-31
出版物タイトル	eLife
巻	13巻
出版者	eLife Sciences Publications
開始ページ	RP99858
ISSN	2050-084X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© Kato, Nakajima, Xing et al.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	39480899
DOI	10.7554/eLife.99858
Web of Science KeyUT	001394525300001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.7554/eLife.99858

Conformational Flexibility of D1-Glu189: A Crucial Determinant in Substrate Water Selection, Positioning, and Stabilization within the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Isobe, Hiroshi\| Suzuki, Takayoshi\| Suga, Michihiro\| Shen, Jian-Ren\| Yamaguchi, Kizashi\|
発行日	2024-12-05
出版物タイトル	ACS Omega
巻	9巻
号	50号
出版者	American Chemical Society
開始ページ	50041
終了ページ	50048
ISSN	2470-1343
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2024 The Authors.
論文のバージョン	publisher
DOI	10.1021/acsomega.4c09981
Web of Science KeyUT	001370921200001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acsomega.4c09981

Structure of a diatom photosystem II supercomplex containing a member of Lhcx family and dimeric FCPII

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Feng, Yue\| Li, Zhenhua\| Li, Xiaoyi\| Shen, Lili\| Liu, Xueyang\| Zhou, Cuicui\| Zhang, Jinyang\| Sang, Min\| Han, Guangye\| Yang, Wenqiang\| Kuang, Tingyun\| Wang, Wenda\| Shen, Jian-Ren\|
発行日	2023-10-25
出版物タイトル	Science Advances
巻	9巻
号	43号
出版者	American Association for the Advancement of Science
開始ページ	eadi8446
ISSN	2375-2548
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 The Authors
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37878698
DOI	10.1126/sciadv.adi8446
Web of Science KeyUT	001261640600010
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1126/sciadv.adi8446

Structure and distinct supramolecular organization of a PSII-ACPII dimer from a cryptophyte alga Chroomonas placoidea

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Mao, Zhiyuan\| Li, Xingyue\| Li, Zhenhua\| Shen, Liangliang\| Li, Xiaoyi\| Yang, Yanyan\| Wang, Wenda\| Kuang, Tingyun\| Shen, Jian-Ren\| Han, Guangye\|
備考	The version of record of this article, first published in Nature Communications, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-48878-x\|
発行日	2024-05-28
出版物タイトル	Nature Communications
巻	15巻
号	1号
出版者	Nature Portfolio
開始ページ	4535
ISSN	2041-1723
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2024
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	38806516
DOI	10.1038/s41467-024-48878-x
Web of Science KeyUT	001234660500031
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41467-024-48878-x

Oxygen-evolving photosystem II structures during S1–S2–S3 transitions

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Li, Hongjie\| Nakajima, Yoshiki\| Nango, Eriko\| Owada, Shigeki\| Yamada, Daichi\| Hashimoto, Kana\| Luo, Fangjia\| Tanaka, Rie\| Akita, Fusamichi\| Kato, Koji\| Kang, Jungmin\| Saitoh, Yasunori\| Kishi, Shunpei\| Yu, Huaxin\| Matsubara, Naoki\| Fujii, Hajime\| Sugahara, Michihiro\| Suzuki, Mamoru\| Masuda, Tetsuya\| Kimura, Tetsunari\| Thao, Tran Nguyen\| Yonekura, Shinichiro\| Yu, Long-Jiang\| Tosha, Takehiko\| Tono, Kensuke\| Joti, Yasumasa\| Hatsui, Takaki\| Yabashi, Makina\| Kubo, Minoru\| Iwata, So\| Isobe, Hiroshi\| Yamaguchi, Kizashi\| Suga, Michihiro\| Shen, Jian-Ren\|
備考	The version of record of this article, first published in Nature, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41586-023-06987-5\|
発行日	2024-01-31
出版物タイトル	Nature
巻	626巻
号	7999号
出版者	Springer Science and Business Media LLC
開始ページ	670
終了ページ	677
ISSN	0028-0836
NCID	AA00752384
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2024
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	38297122
DOI	10.1038/s41586-023-06987-5
Web of Science KeyUT	001179152900004
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41586-023-06987-5

Structural insights into photosystem II supercomplex and trimeric FCP antennae of a centric diatom Cyclotella meneghiniana

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Zhao, Songhao\| Shen, Lili\| Li, Xiaoyi\| Tao, Qiushuang\| Li, Zhenhua\| Xu, Caizhe\| Zhou, Cuicui\| Yang, Yanyan\| Sang, Min\| Han, Guangye\| Yu, Long-Jiang\| Kuang, Tingyun\| Shen, Jian-Ren\| Wang, Wenda\|
備考	The version of record of this article, first published in Nature Communications, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-44055-8\|
発行日	2023-12-09
出版物タイトル	Nature Communications
巻	14巻
号	1号
出版者	Nature Portfolio
開始ページ	8164
ISSN	2041-1723
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2023
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	38071196
DOI	10.1038/s41467-023-44055-8
Web of Science KeyUT	001118826100025
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41467-023-44055-8

Structural insights into the action mechanisms of artificial electron acceptors in photosystem II

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kamada, Shinji\| Nakajima, Yoshiki\| Shen, Jian-Ren\|
キーワード	Photosystem II photosynthesis electron transfer structural biology crystal structure electron acceptor
発行日	2023-07
出版物タイトル	Journal of Biological Chemistry
巻	299巻
号	7号
出版者	Elsevier
開始ページ	104839
ISSN	1083-351X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 The Authors.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37209822
DOI	10.1016/j.jbc.2023.104839
Web of Science KeyUT	001166336800001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.jbc.2023.104839

Structure of a monomeric photosystem I core associated with iron-stress-induced-A proteins from Anabaena sp. PCC 7120

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Nagao, Ryo\| Kato, Koji\| Hamaguchi, Tasuku\| Ueno, Yoshifumi\| Tsuboshita, Naoki\| Shimizu, Shota\| Furutani, Miyu\| Ehira, Shigeki\| Nakajima, Yoshiki\| Kawakami, Keisuke\| Suzuki, Takehiro\| Dohmae, Naoshi\| Akimoto, Seiji\| Yonekura, Koji\| Shen, Jian-Ren\|
備考	The version of record of this article, first published in Nature Communications, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-36504-1\|
発行日	2023-02-17
出版物タイトル	Nature Communications
巻	14巻
号	1号
出版者	Nature Portfolio
開始ページ	920
ISSN	2041-1723
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2023
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	36805598
DOI	10.1038/s41467-023-36504-1
Web of Science KeyUT	001002516000009
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41467-023-36504-1

Geometric, electronic and spin structures of the CaMn4O5 catalyst for water oxidation in oxygen-evolving photosystem II. Interplay between experiments and theoretical computations

フルテキストURL	fulltext20221122-4.pdf
著者	Yamaguchi, Kizashi\| Shoji, Mitsuo\| Isobe, Hiroshi\| Kawakami, Takashi\| Miyagawa, Koichi\| Suga, Michihiro\| Akita, Fusamichi\| Shen, Jian-Ren\|
キーワード	Water oxidation Oxygen evolution Photosystem II HR XRD SFX XFEL QM/MM calculation DLPNO CCSD(T-0) computations, Oxyl radical character
備考	(C) 2022 Elsevier B.V. This manuscript version is made available under the CC-BY-NC-ND 4.0 License. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/. This is the accepted manuscript version. The formal published version is available at https://doi.org/10.1016/j.ccr.2022.214742\| This full-text file will be available in Aug. 2024.\|
発行日	2022-11
出版物タイトル	Coordination Chemistry Reviews
巻	471巻
出版者	Elsevier BV
開始ページ	214742
ISSN	0010-8545
NCID	AA00619249
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2022 Elsevier B.V.
論文のバージョン	author
DOI	10.1016/j.ccr.2022.214742
Web of Science KeyUT	000879286600003
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.ccr.2022.214742

Roles of the Flexible Primary Coordination Sphere of the Mn4CaOx Cluster: What Are the Immediate Decay Products of the S-3 State?

フルテキストURL	fulltext20221114-1.pdf
著者	Isobe, Hiroshi\| Shoji, Mitsuo\| Suzuki, Takayoshi\| Shen, Jian-Ren\| Yamaguchi, Kizashi\|
備考	This document is the Accepted Manuscript version of a Published Work that appeared in final form in The Journal of Physical Chemistry B, copyright © American Chemical Society after peer review and technical editing by the publisher. To access the final edited and published work see https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.2c02596\| This full-text will be available in Sep. 2023.\|
発行日	2022-09-15
出版物タイトル	The Journal of Physical Chemistry B
巻	126巻
号	38号
出版者	American Chemical Society (ACS)
開始ページ	7212
終了ページ	7228
ISSN	1520-6106
NCID	AA11114073
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2022 American Chemical Society
論文のバージョン	author
PubMed ID	36107406
DOI	10.1021/acs.jpcb.2c02596
Web of Science KeyUT	000863255500001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.2c02596

Structural basis for the absence of low-energy chlorophylls in a photosystem I trimer from Gloeobacter violaceus

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kato, Koji\| Hamaguchi, Tasuku\| Nagao, Ryo\| Kawakami, Keisuke\| Ueno, Yoshifumi\| Suzuki, Takehiro\| Uchida, Hiroko\| Murakami, Akio\| Nakajima, Yoshiki\| Yokono, Makio\| Akimoto, Seiji\| Dohmae, Naoshi\| Yonekura, Koji\| Shen, Jian-Ren\|
キーワード	photosystem I cryo-EM low-energy Chl Gloeobacter Other
発行日	2022-04-11
出版物タイトル	Elife
巻	11巻
出版者	eLIFE SCIENCES PUBL LTD
開始ページ	e73990
ISSN	2050-084X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© Kato et al.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	35404232
DOI	10.7554/eLife.73990
Web of Science KeyUT	000790476900001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.7554/eLife.73990

Structural basis for different types of hetero-tetrameric light-harvesting complexes in a diatom PSII-FCPII supercomplex

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Nagao, Ryo\| Kato, Koji\| Kumazawa, Minoru\| Ifuku, Kentaro\| Yokono, Makio\| Suzuki, Takehiro\| Dohmae, Naoshi\| Akita, Fusamichi\| Akimoto, Seiji\| Miyazaki, Naoyuki\| Shen, Jian-Ren\|
発行日	2022-04-01
出版物タイトル	Nature Communications
巻	13巻
号	1号
出版者	Nature Portfolio
開始ページ	1764
ISSN	2041-1723
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2022
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	35365610
DOI	10.1038/s41467-022-29294-5
Web of Science KeyUT	000777408600010
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41467-022-29294-5

Structural basis for high selectivity of a rice silicon channel Lsi1

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Saitoh, Yasunori\| Mitani-Ueno, Namiki\| Saito, Keisuke\| Matsuki, Kengo\| Huang, Sheng\| Yang, Lingli\| Yamaji, Naoki\| Ishikita, Hiroshi\| Shen, Jian-Ren\| Ma, Jian Feng\| Suga, Michihiro\|
発行日	2021-10-29
出版物タイトル	Nature Communications
巻	12巻
号	1号
出版者	Nature Portfolio
開始ページ	6236
ISSN	2041-1723
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2021
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	34716344
DOI	10.1038/s41467-021-26535-x
Web of Science KeyUT	000712910500004
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41467-021-26535-x

High-resolution cryo-EM structure of photosystem II reveals damage from high-dose electron beams

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kato, Koji\| Miyazaki, Naoyuki\| Hamaguchi, Tasuku\| Nakajima, Yoshiki\| Akita, Fusamichi\| Yonekura, Koji\| Shen, Jian-Ren\|
発行日	2021-03-22
出版物タイトル	Communications Biology
巻	4巻
号	1号
出版者	Springer
開始ページ	382
ISSN	2399-3642
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	publisher
DOI	10.1038/s42003-021-01919-3
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s42003-021-01919-3

Structure of photosystem I-LHCI-LHCII from the green alga Chlamydomonas reinhardtii in State 2

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Huang, Zihui\| Shen, Liangliang\| Wang, Wenda\| Mao, Zhiyuan\| Yi, Xiaohan\| Kuang, Tingyun\| Shen, Jian-Ren\| Zhang, Xing\| Han, Guangye\|
発行日	2021-02-17
出版物タイトル	Nature Communications
巻	12巻
号	1号
出版者	Nature
開始ページ	1100
ISSN	2041-1723
NCID	AA12645905
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2021
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	33597543
DOI	10.1038/s41467-021-21362-6
Web of Science KeyUT	000621232800019
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41467-021-21362-6

Antenna arrangement and energy-transfer pathways of PSI-LHCI from the moss Physcomitrella patens

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Yan, Qiujing\| Zhao, Liang\| Wang, Wenda\| Pi, Xiong\| Han, Guangye\| Wang, Jie\| Cheng, Lingpeng\| He, Yi-Kun\| Kuang, Tingyun\| Qin, Xiaochun\| Sui, Sen-Fang\| Shen, Jian-Ren\|
発行日	2021-02-16
出版物タイトル	Cell Discovery
巻	7巻
号	1号
出版者	Springer Nature
開始ページ	10
ISSN	2056-5968
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2021
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	33589616
DOI	10.1038/s41421-021-00242-9
Web of Science KeyUT	000618354400001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41421-021-00242-9

Exploring reaction pathways for the structural rearrangements of the Mn cluster induced by water binding in the S3 state of the oxygen evolving complex of photosystem II

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Isobe, Hiroshi\| Shoji, Mitsuo\| Suzuki, Takayoshi\| Shen, Jian-Ren\| Yamaguchi, Kizashi\|
キーワード	Photosynthesis Water oxidation Photosystem II Oxygen evolving complex Mn4CaO6 cluster Ligand environment
備考	© 2020 Elsevier B.V. This manuscript version is made available under the CC-BY-NC-ND 4.0 License. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/. This is the accepted manuscript version. The formal published version is available at [https://doi.org/10.1016/j.jphotochem.2020.112905] . \|
発行日	2021-01-15
出版物タイトル	Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry
巻	405巻
出版者	Elsevier
開始ページ	112905
ISSN	1010-6030
NCID	AA10684407
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2020 Elsevier B.V.
論文のバージョン	author
DOI	10.1016/j.jphotochem.2020.112905
オフィシャル URL	https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1010603020307024\|
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.jphotochem.2020.112905

Structural basis for energy transfer in a huge diatom PSI-FCPI supercomplex

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Xu, Caizhe\| Pi, Xiong\| Huang, Yawen\| Han, Guangye\| Chen, Xiaobo\| Qin, Xiaochun\| Huang, Guoqiang\| Zhao, Songhao\| Yang, Yanyan\| Kuang, Tingyun\| Wang, Wenda\| Sui, Sen-Fang\| Shen, Jian-Ren\|
キーワード	Bioenergetics Cryoelectron microscopy Photosystem I
発行日	2020-10-08
出版物タイトル	Nature Communications
巻	11巻
号	1号
出版者	Nature Research
開始ページ	5081
ISSN	2041-1723
NCID	AA12645905
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2020
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	33033236
DOI	10.1038/s41467-020-18867-x
Web of Science KeyUT	000581918200012
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41467-020-18867-x

Spectral tuning of light-harvesting complex II in the siphonous alga Bryopsis corticulans and its effect on energy transfer dynamics

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Akhtar, Parveen\| Nowakowski, Paweł J.\| Wang, Wenda\| Do, Thanh Nhut\| Zhao, Songhao\| Siligardi, Giuliano\| Garab, Győző\| Shen, Jian-Ren\| Tan, Howe-Siang\| Lambrev, Petar H.\|
キーワード	Circular dichroism Light-harvesting complexes Marine algae Photosynthesis Time-resolved spectroscopy Two-dimensional spectroscopy
発行日	2020-07-01
出版物タイトル	Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics
巻	1861巻
号	7号
出版者	Elsevier
開始ページ	148191
ISSN	0005-2728
NCID	AA00564646
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2020 The Authors
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	32201306
DOI	10.1016/j.bbabio.2020.148191
Web of Science KeyUT	000536941400006
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.bbabio.2020.148191

Structure of a cyanobacterial photosystem I surrounded by octadecameric IsiA antenna proteins

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Akita, Fusamichi\| Nagao, Ryo\| Kato, Koji\| Nakajima, Yoshiki\| Yokono, Makio\| Ueno, Yoshifumi\| Suzuki, Takehiro\| Dohmae, Naoshi\| Shen, Jian-Ren\| Akimoto, Seiji\| Miyazaki, Naoyuki\|
キーワード	Cryoelectron microscopy Photosystem I
発行日	2020-05-11
出版物タイトル	Communications Biology
巻	3巻
号	1号
出版者	Nature
開始ページ	232
ISSN	2399-3642
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2020
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	32393811
DOI	10.1038/s42003-020-0949-6
Web of Science KeyUT	000534339100004
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s42003-020-0949-6

沈 建仁